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En la página Proteasoma:

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La fuerza de la unión MHC clase I y su ligando depende de la composición del extremo C-terminal del ligando. Los péptidos se unen mediante uniones puente de hidrógeno y mediante el contacto cercano con la región llamada "B pocket" de la superficie del MHC I. Varios alelos de MHC clase I presentan mayor afinidad por los residuos C-terminales hidrofóbicos de los péptidos; el inmunoproteosoma tiende a generar péptidos con extremos C-terminales hidrofóbicos.[cita requerida]